主角工藤新一原本是一位颇具名声的高中生侦探，在目击黑暗组织的地下交易后，正准备追踪时却被突袭击昏，并被灌下代号为“APTX4869”的不明药物。后来虽然幸免于死，但身体就此缩小为小学时期的模样。之后他化名为江户川柯南，在邻居阿笠博士的建议下，寄住在女友毛利兰的父亲—侦探毛利小五郎家中，继续秘密从事追查黑暗组织的工作，并私下探寻获得解药的管道，希望能够恢复原来新一的样貌。与此同时，柯南凭着自己的推理天份，配合阿笠博士为他发明的道具，帮助毛利小五郎成为出名的大侦探。故事内容当中穿插许多爱情、友情、犯罪、背叛、

魔神工匠东卡拉林的魔神工厂位于创界山的下部，某日，工厂遭到了魔界使者金卡库和银卡库的袭击，他们的目标是东卡拉林潜心研制出的究极装备皇帝龙。在命悬一线的十万火急之中，东卡拉林的徒弟特娜丽乔装打扮逃了出来，幸运的遇见了刚好路过的忍部火美子，得知事态紧急，火美子找到了战部渡，一行人向魔神工厂进发。东卡拉林告诉战部渡，只有依靠皇帝龙的力量才能彻底击退源源不断的魔界士兵，而开启皇帝龙的钥匙，正是战部渡的龙王之剑。然而，魔界使者的实力实在是太强大了，战部渡一行人有好几次都陷入了危机之中。

毛利兰的朋友富家千金铃木园子说铃木财团准备展出他们家珍藏的沙皇尼古拉二世家的宝物——回忆之卵，回忆之卵里收藏了沙皇尼古拉二世一家的珍贵照片，因此特别地珍贵。在得知这一消息后，专偷宝石的怪盗基德寄出了犯案预告函，声称要来夺取这价值连城的皇家艺术之宝。预告函上面用谜语的方式列明了他前来盗取宝物的时间。毛利兰的爸爸毛利小五郎是被誉为“沉睡的小五郎”的名侦探。于是，铃木园子找到毛利兰的爸爸毛利小五郎，希望他能来帮忙阻止怪盗基德犯案。活跃在毛利小五郎身后的江户川柯南随同毛利兰等人一起前来展出会馆。江户川柯南还遇到了

针对警察的连续杀人案件发生了，连续有两位东京警视厅的警察遇害了。柯南在街头目睹一名正打电话的警察在雨中被射杀，忙去追踪凶手，但凶手逃脱了。死者闭眼一刻紧抓左胸，似乎有所暗示。事后柯南从目暮警官口中了解到紧抓左胸是暗示那里有警察手册。不久又有警察手拿警察手册被人射杀于地下车库。对于这两起案件，目暮警官等人一反常态不愿向毛利小五郎及柯南透露太多信息。毛利小五郎不甘心进一步追问，白鸟警官只答一句“Need not to know”。该话是警察之间所用的密语，意味着这两起杀人事件与警察内部人士有关。 柯南、小兰等

某天，毛利侦探事务所接到了知名舞台剧女演员牧树里的委托。委托内容是牧树里收到怪盗基德预告信，信中指出怪盗基德将在舞台上夺取牧树里佩带的蓝宝石戒指“命运的宝石”。于是毛利小五郎接受保护宝石的工作，依据毛利小五郎的推理，基德将在演出的最后一天前来盗取这颗无价的宝石。在演出的最后一天，毛利小五郎、小兰和柯南受邀观赏舞台剧，在剧场里错综复杂的人群中，基德到底会假扮成谁出现在大家面前，在紧张的埋伏等候中，出现在大家面前的竟然是工藤新一，柯南一方面必须保护宝石，另一方面又不能拆穿基德假扮的工藤新一，因为拆穿基德就等于

曾经因魔王巴铎拉而陷入苦难的世界，在被称作「勇者」的一位剑士和他的同伴手中恢复了和平——时光流逝…。从魔王手中解放的怪物们所生活的南海孤岛·迪尔穆林岛。岛上唯一的人类、憧憬勇者的少年「达伊」，与怪物们过着和平的生活。但这样的日子，也随着魔王巴铎拉的复活而转变。与师父的约定、与伙伴的相遇、无法逃离的宿命…为了拯救再次面临危机的世界，以勇者为目标的少年·达伊的冒险开始了！